Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXF2Q12947 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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