Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms