Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF3P61204 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF3P61204 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF3P61204 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF3P61204 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF3P61204 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF3P61204 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF3P61204 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF3P61204 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF3P61204 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF3P61204 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF3P61204 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF3P61204 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF3P61204 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF3P61204 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF3P61204 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF3P61204 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF3P61204 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF3P61204 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF3P61204 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF3P61204 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF3P61204 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF3P61204 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF3P61204 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF3P61204 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF3P61204 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF3P61204 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF3P61204 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF3P61204 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF3P61204 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF3P61204 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF3P61204 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF3P61204 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF3P61204 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF3P61204 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF3P61204 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF3P61204 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF3P61204 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF3P61204 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF3P61204 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF3P61204 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF3P61204 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF3P61204 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF3P61204 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF3P61204 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF3P61204 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF3P61204 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF3P61204 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF3P61204 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF3P61204 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF3P61204 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF3P61204 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF3P61204 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF3P61204 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF3P61204 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF3P61204 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF3P61204 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF3P61204 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF3P61204 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF3P61204 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF3P61204 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF3P61204 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF3P61204 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF3P61204 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF3P61204 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF3P61204 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF3P61204 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF3P61204 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF3P61204 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF3P61204 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF3P61204 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF3P61204 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF3P61204 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF3P61204 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF3P61204 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF3P61204 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF3P61204 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF3P61204 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF3P61204 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF3P61204 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF3P61204 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF3P61204 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF3P61204 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF3P61204 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF3P61204 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF3P61204 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF3P61204 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF3P61204 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF3P61204 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF3P61204 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF3P61204 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF3P61204 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF3P61204 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF3P61204 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF3P61204 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF3P61204 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF3P61204 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF3P61204 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF3P61204 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF3P61204 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms