Protein–RNA interactions for Protein: P59646

FXYD4, FXYD domain-containing ion transport regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXYD4P59646 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FXYD4P59646 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FXYD4P59646 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms