Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2BFSP57053 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms