Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms