Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT3P49368 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT3P49368 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT3P49368 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT3P49368 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT3P49368 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT3P49368 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCT3P49368 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT3P49368 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT3P49368 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT3P49368 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCT3P49368 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT3P49368 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT3P49368 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT3P49368 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT3P49368 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT3P49368 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT3P49368 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT3P49368 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT3P49368 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT3P49368 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT3P49368 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT3P49368 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT3P49368 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT3P49368 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT3P49368 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT3P49368 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT3P49368 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT3P49368 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCT3P49368 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT3P49368 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCT3P49368 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCT3P49368 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT3P49368 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT3P49368 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT3P49368 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT3P49368 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT3P49368 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT3P49368 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT3P49368 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT3P49368 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT3P49368 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT3P49368 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT3P49368 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT3P49368 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT3P49368 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT3P49368 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT3P49368 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT3P49368 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT3P49368 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT3P49368 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT3P49368 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT3P49368 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT3P49368 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT3P49368 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT3P49368 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT3P49368 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT3P49368 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT3P49368 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT3P49368 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT3P49368 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCT3P49368 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCT3P49368 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCT3P49368 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms