Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP5C1P36542 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms