Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
S100A1P23297 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
S100A1P23297 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
S100A1P23297 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
S100A1P23297 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
S100A1P23297 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
S100A1P23297 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
S100A1P23297 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
S100A1P23297 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
S100A1P23297 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
S100A1P23297 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
S100A1P23297 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
S100A1P23297 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
S100A1P23297 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
S100A1P23297 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
S100A1P23297 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
S100A1P23297 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
S100A1P23297 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
S100A1P23297 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
S100A1P23297 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
S100A1P23297 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
S100A1P23297 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
S100A1P23297 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
S100A1P23297 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
S100A1P23297 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
S100A1P23297 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
S100A1P23297 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
S100A1P23297 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
S100A1P23297 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
S100A1P23297 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
S100A1P23297 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
S100A1P23297 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
S100A1P23297 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
S100A1P23297 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
S100A1P23297 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
S100A1P23297 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
S100A1P23297 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
S100A1P23297 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
S100A1P23297 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
S100A1P23297 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
S100A1P23297 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
S100A1P23297 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
S100A1P23297 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
S100A1P23297 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
S100A1P23297 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
S100A1P23297 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
S100A1P23297 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
S100A1P23297 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
S100A1P23297 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
S100A1P23297 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
S100A1P23297 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
S100A1P23297 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
S100A1P23297 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
S100A1P23297 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
S100A1P23297 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
S100A1P23297 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
S100A1P23297 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
S100A1P23297 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
S100A1P23297 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
S100A1P23297 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
S100A1P23297 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
S100A1P23297 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
S100A1P23297 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
S100A1P23297 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
S100A1P23297 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
S100A1P23297 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms