Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms