Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMED5Q9Y3A6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms