Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POMPQ9Y244 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms