Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBX8

LGR6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR6Q9HBX8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR6Q9HBX8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGR6Q9HBX8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms