Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ROPN1BQ9BZX4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms