Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GABARAPL3Q9BY60 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPL3Q9BY60 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms