Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3GL3Q99963 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms