Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MALSU1Q96EH3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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