Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms