Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAVIN3Q969G5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAVIN3Q969G5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms