Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TAF4BQ92750 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF4BQ92750 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF4BQ92750 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF4BQ92750 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF4BQ92750 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF4BQ92750 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF4BQ92750 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF4BQ92750 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF4BQ92750 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF4BQ92750 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF4BQ92750 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF4BQ92750 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF4BQ92750 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF4BQ92750 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF4BQ92750 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF4BQ92750 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF4BQ92750 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF4BQ92750 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF4BQ92750 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF4BQ92750 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF4BQ92750 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF4BQ92750 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF4BQ92750 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF4BQ92750 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF4BQ92750 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF4BQ92750 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF4BQ92750 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF4BQ92750 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF4BQ92750 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF4BQ92750 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF4BQ92750 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF4BQ92750 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF4BQ92750 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF4BQ92750 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms