Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC112Q8NEF3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC112Q8NEF3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC112Q8NEF3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC112Q8NEF3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC112Q8NEF3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC112Q8NEF3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC112Q8NEF3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC112Q8NEF3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms