Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNBD1Q8NA66 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms