Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC84Q86UT8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms