Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCD3Q6STE5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms