Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms