Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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COL9A2Q14055 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COL9A2Q14055 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL9A2Q14055 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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