Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HSPB3Q12988 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms