Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BNIP1Q12981 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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