Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PAX8Q06710 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms