Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCAMP50895 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCAMP50895 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BCAMP50895 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCAMP50895 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCAMP50895 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCAMP50895 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCAMP50895 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCAMP50895 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCAMP50895 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCAMP50895 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCAMP50895 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCAMP50895 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCAMP50895 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCAMP50895 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCAMP50895 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCAMP50895 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCAMP50895 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCAMP50895 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCAMP50895 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCAMP50895 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCAMP50895 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCAMP50895 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCAMP50895 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCAMP50895 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCAMP50895 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAMP50895 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAMP50895 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAMP50895 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAMP50895 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAMP50895 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAMP50895 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAMP50895 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAMP50895 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAMP50895 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAMP50895 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAMP50895 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAMP50895 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAMP50895 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAMP50895 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAMP50895 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAMP50895 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAMP50895 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAMP50895 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAMP50895 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAMP50895 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BCAMP50895 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCAMP50895 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCAMP50895 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCAMP50895 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCAMP50895 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCAMP50895 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCAMP50895 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCAMP50895 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCAMP50895 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BCAMP50895 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCAMP50895 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCAMP50895 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCAMP50895 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCAMP50895 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCAMP50895 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCAMP50895 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCAMP50895 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCAMP50895 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCAMP50895 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCAMP50895 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAMP50895 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAMP50895 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAMP50895 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAMP50895 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAMP50895 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAMP50895 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAMP50895 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAMP50895 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAMP50895 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAMP50895 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAMP50895 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAMP50895 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAMP50895 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAMP50895 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAMP50895 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAMP50895 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAMP50895 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAMP50895 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAMP50895 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAMP50895 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAMP50895 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAMP50895 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAMP50895 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAMP50895 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAMP50895 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAMP50895 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCAMP50895 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAMP50895 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAMP50895 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAMP50895 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAMP50895 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAMP50895 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAMP50895 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAMP50895 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms