Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ABCC1P33527 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms