Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCLP19338 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCLP19338 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCLP19338 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCLP19338 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCLP19338 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCLP19338 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCLP19338 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCLP19338 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCLP19338 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCLP19338 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCLP19338 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCLP19338 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCLP19338 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCLP19338 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCLP19338 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCLP19338 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCLP19338 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLP19338 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLP19338 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLP19338 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLP19338 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLP19338 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLP19338 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLP19338 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLP19338 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLP19338 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLP19338 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLP19338 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLP19338 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLP19338 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLP19338 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLP19338 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLP19338 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLP19338 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLP19338 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLP19338 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLP19338 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLP19338 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLP19338 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLP19338 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLP19338 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLP19338 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLP19338 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLP19338 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLP19338 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLP19338 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCLP19338 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCLP19338 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCLP19338 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCLP19338 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCLP19338 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCLP19338 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCLP19338 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCLP19338 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCLP19338 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCLP19338 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCLP19338 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCLP19338 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCLP19338 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCLP19338 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCLP19338 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCLP19338 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCLP19338 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCLP19338 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCLP19338 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCLP19338 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCLP19338 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCLP19338 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCLP19338 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCLP19338 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCLP19338 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCLP19338 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCLP19338 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCLP19338 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCLP19338 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCLP19338 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCLP19338 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCLP19338 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCLP19338 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCLP19338 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NCLP19338 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NCLP19338 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCLP19338 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCLP19338 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCLP19338 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCLP19338 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCLP19338 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCLP19338 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCLP19338 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCLP19338 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCLP19338 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCLP19338 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCLP19338 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCLP19338 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCLP19338 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCLP19338 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCLP19338 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCLP19338 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCLP19338 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms