Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms