Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C6orf47O95873 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms