Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAB2O43741 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms