Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DENRO43583 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DENRO43583 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DENRO43583 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DENRO43583 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DENRO43583 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DENRO43583 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DENRO43583 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DENRO43583 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DENRO43583 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DENRO43583 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DENRO43583 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DENRO43583 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DENRO43583 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DENRO43583 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DENRO43583 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DENRO43583 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DENRO43583 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DENRO43583 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DENRO43583 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DENRO43583 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DENRO43583 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DENRO43583 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DENRO43583 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DENRO43583 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DENRO43583 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DENRO43583 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DENRO43583 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DENRO43583 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DENRO43583 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DENRO43583 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DENRO43583 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DENRO43583 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DENRO43583 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DENRO43583 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DENRO43583 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DENRO43583 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DENRO43583 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DENRO43583 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DENRO43583 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DENRO43583 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DENRO43583 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DENRO43583 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DENRO43583 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DENRO43583 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DENRO43583 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DENRO43583 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DENRO43583 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DENRO43583 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DENRO43583 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DENRO43583 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DENRO43583 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DENRO43583 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DENRO43583 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DENRO43583 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DENRO43583 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
DENRO43583 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DENRO43583 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms