Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF1O43189 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF1O43189 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF1O43189 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF1O43189 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF1O43189 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF1O43189 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHF1O43189 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHF1O43189 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF1O43189 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF1O43189 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF1O43189 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF1O43189 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF1O43189 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF1O43189 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF1O43189 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF1O43189 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF1O43189 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF1O43189 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF1O43189 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF1O43189 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF1O43189 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF1O43189 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF1O43189 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF1O43189 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHF1O43189 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms