Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms