Protein–RNA interactions for Protein: V9GYV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYV3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
V9GYV3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
V9GYV3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
V9GYV3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
V9GYV3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
V9GYV3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
V9GYV3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
V9GYV3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
V9GYV3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
V9GYV3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
V9GYV3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
V9GYV3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
V9GYV3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
V9GYV3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
V9GYV3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
V9GYV3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
V9GYV3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
V9GYV3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
V9GYV3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
V9GYV3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
V9GYV3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
V9GYV3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
V9GYV3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
V9GYV3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
V9GYV3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
V9GYV3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
V9GYV3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
V9GYV3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
V9GYV3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
V9GYV3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
V9GYV3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
V9GYV3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
V9GYV3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
V9GYV3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
V9GYV3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
V9GYV3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
V9GYV3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
V9GYV3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
V9GYV3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
V9GYV3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
V9GYV3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
V9GYV3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
V9GYV3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
V9GYV3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
V9GYV3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
V9GYV3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
V9GYV3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
V9GYV3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
V9GYV3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
V9GYV3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
V9GYV3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
V9GYV3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
V9GYV3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
V9GYV3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
V9GYV3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
V9GYV3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
V9GYV3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
V9GYV3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
V9GYV3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
V9GYV3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
V9GYV3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
V9GYV3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
V9GYV3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
V9GYV3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
V9GYV3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
V9GYV3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
V9GYV3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
V9GYV3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
V9GYV3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
V9GYV3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
V9GYV3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
V9GYV3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
V9GYV3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
V9GYV3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
V9GYV3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
V9GYV3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
V9GYV3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
V9GYV3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
V9GYV3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
V9GYV3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
V9GYV3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
V9GYV3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
V9GYV3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
V9GYV3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
V9GYV3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
V9GYV3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
V9GYV3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
V9GYV3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
V9GYV3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
V9GYV3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
V9GYV3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
V9GYV3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
V9GYV3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
V9GYV3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
V9GYV3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
V9GYV3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
V9GYV3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
V9GYV3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
V9GYV3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
V9GYV3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms