Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFL3Q9Y3E1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL3Q9Y3E1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL3Q9Y3E1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL3Q9Y3E1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL3Q9Y3E1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL3Q9Y3E1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL3Q9Y3E1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL3Q9Y3E1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDGFL3Q9Y3E1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HDGFL3Q9Y3E1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HDGFL3Q9Y3E1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HDGFL3Q9Y3E1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDGFL3Q9Y3E1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL3Q9Y3E1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL3Q9Y3E1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL3Q9Y3E1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL3Q9Y3E1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HDGFL3Q9Y3E1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDGFL3Q9Y3E1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDGFL3Q9Y3E1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDGFL3Q9Y3E1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDGFL3Q9Y3E1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDGFL3Q9Y3E1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.2 ms