Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
REXO2Q9Y3B8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
REXO2Q9Y3B8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
REXO2Q9Y3B8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
REXO2Q9Y3B8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
REXO2Q9Y3B8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
REXO2Q9Y3B8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
REXO2Q9Y3B8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
REXO2Q9Y3B8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
REXO2Q9Y3B8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
REXO2Q9Y3B8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
REXO2Q9Y3B8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
REXO2Q9Y3B8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
REXO2Q9Y3B8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
REXO2Q9Y3B8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
REXO2Q9Y3B8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
REXO2Q9Y3B8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
REXO2Q9Y3B8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
REXO2Q9Y3B8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
REXO2Q9Y3B8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
REXO2Q9Y3B8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
REXO2Q9Y3B8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
REXO2Q9Y3B8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
REXO2Q9Y3B8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
REXO2Q9Y3B8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
REXO2Q9Y3B8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
REXO2Q9Y3B8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
REXO2Q9Y3B8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
REXO2Q9Y3B8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
REXO2Q9Y3B8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
REXO2Q9Y3B8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
REXO2Q9Y3B8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
REXO2Q9Y3B8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
REXO2Q9Y3B8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
REXO2Q9Y3B8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
REXO2Q9Y3B8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
REXO2Q9Y3B8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
REXO2Q9Y3B8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
REXO2Q9Y3B8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
REXO2Q9Y3B8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
REXO2Q9Y3B8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
REXO2Q9Y3B8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
REXO2Q9Y3B8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
REXO2Q9Y3B8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
REXO2Q9Y3B8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
REXO2Q9Y3B8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
REXO2Q9Y3B8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
REXO2Q9Y3B8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
REXO2Q9Y3B8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
REXO2Q9Y3B8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
REXO2Q9Y3B8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
REXO2Q9Y3B8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
REXO2Q9Y3B8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
REXO2Q9Y3B8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
REXO2Q9Y3B8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
REXO2Q9Y3B8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
REXO2Q9Y3B8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
REXO2Q9Y3B8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
REXO2Q9Y3B8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
REXO2Q9Y3B8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
REXO2Q9Y3B8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
REXO2Q9Y3B8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
REXO2Q9Y3B8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
REXO2Q9Y3B8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
REXO2Q9Y3B8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
REXO2Q9Y3B8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
REXO2Q9Y3B8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
REXO2Q9Y3B8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
REXO2Q9Y3B8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
REXO2Q9Y3B8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
REXO2Q9Y3B8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
REXO2Q9Y3B8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
REXO2Q9Y3B8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
REXO2Q9Y3B8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
REXO2Q9Y3B8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
REXO2Q9Y3B8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
REXO2Q9Y3B8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
REXO2Q9Y3B8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
REXO2Q9Y3B8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
REXO2Q9Y3B8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
REXO2Q9Y3B8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
REXO2Q9Y3B8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
REXO2Q9Y3B8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
REXO2Q9Y3B8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
REXO2Q9Y3B8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
REXO2Q9Y3B8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
REXO2Q9Y3B8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
REXO2Q9Y3B8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
REXO2Q9Y3B8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
REXO2Q9Y3B8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
REXO2Q9Y3B8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
REXO2Q9Y3B8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
REXO2Q9Y3B8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
REXO2Q9Y3B8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
REXO2Q9Y3B8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
REXO2Q9Y3B8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
REXO2Q9Y3B8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
REXO2Q9Y3B8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
REXO2Q9Y3B8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
REXO2Q9Y3B8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms