Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B2

EXOSC1, Exosome complex component CSL4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC1Q9Y3B2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC1Q9Y3B2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC1Q9Y3B2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC1Q9Y3B2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC1Q9Y3B2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC1Q9Y3B2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC1Q9Y3B2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC1Q9Y3B2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC1Q9Y3B2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC1Q9Y3B2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC1Q9Y3B2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC1Q9Y3B2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC1Q9Y3B2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC1Q9Y3B2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC1Q9Y3B2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC1Q9Y3B2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC1Q9Y3B2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC1Q9Y3B2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC1Q9Y3B2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC1Q9Y3B2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC1Q9Y3B2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC1Q9Y3B2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EXOSC1Q9Y3B2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC1Q9Y3B2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC1Q9Y3B2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC1Q9Y3B2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC1Q9Y3B2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC1Q9Y3B2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC1Q9Y3B2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC1Q9Y3B2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC1Q9Y3B2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC1Q9Y3B2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC1Q9Y3B2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC1Q9Y3B2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC1Q9Y3B2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC1Q9Y3B2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC1Q9Y3B2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC1Q9Y3B2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC1Q9Y3B2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC1Q9Y3B2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC1Q9Y3B2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC1Q9Y3B2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXOSC1Q9Y3B2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXOSC1Q9Y3B2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EXOSC1Q9Y3B2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EXOSC1Q9Y3B2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC1Q9Y3B2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC1Q9Y3B2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC1Q9Y3B2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC1Q9Y3B2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC1Q9Y3B2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC1Q9Y3B2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC1Q9Y3B2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC1Q9Y3B2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC1Q9Y3B2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC1Q9Y3B2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC1Q9Y3B2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC1Q9Y3B2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC1Q9Y3B2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC1Q9Y3B2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC1Q9Y3B2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC1Q9Y3B2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC1Q9Y3B2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC1Q9Y3B2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC1Q9Y3B2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC1Q9Y3B2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC1Q9Y3B2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC1Q9Y3B2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC1Q9Y3B2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC1Q9Y3B2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC1Q9Y3B2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC1Q9Y3B2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC1Q9Y3B2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC1Q9Y3B2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC1Q9Y3B2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC1Q9Y3B2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC1Q9Y3B2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC1Q9Y3B2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC1Q9Y3B2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC1Q9Y3B2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC1Q9Y3B2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC1Q9Y3B2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC1Q9Y3B2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC1Q9Y3B2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC1Q9Y3B2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC1Q9Y3B2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC1Q9Y3B2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC1Q9Y3B2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC1Q9Y3B2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC1Q9Y3B2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC1Q9Y3B2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC1Q9Y3B2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC1Q9Y3B2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC1Q9Y3B2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC1Q9Y3B2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC1Q9Y3B2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC1Q9Y3B2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EXOSC1Q9Y3B2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC1Q9Y3B2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC1Q9Y3B2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms