Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X8

UBE2D4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D4, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4Q9Y2X8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2D4Q9Y2X8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2D4Q9Y2X8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2D4Q9Y2X8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2D4Q9Y2X8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2D4Q9Y2X8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2D4Q9Y2X8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2D4Q9Y2X8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2D4Q9Y2X8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2D4Q9Y2X8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2D4Q9Y2X8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2D4Q9Y2X8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2D4Q9Y2X8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2D4Q9Y2X8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2D4Q9Y2X8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2D4Q9Y2X8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2D4Q9Y2X8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2D4Q9Y2X8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2D4Q9Y2X8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2D4Q9Y2X8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBE2D4Q9Y2X8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBE2D4Q9Y2X8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBE2D4Q9Y2X8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBE2D4Q9Y2X8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE2D4Q9Y2X8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2D4Q9Y2X8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms