Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D2

SLC35A3, UDP-N-acetylglucosamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A3Q9Y2D2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC35A3Q9Y2D2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC35A3Q9Y2D2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC35A3Q9Y2D2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC35A3Q9Y2D2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC35A3Q9Y2D2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC35A3Q9Y2D2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC35A3Q9Y2D2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC35A3Q9Y2D2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC35A3Q9Y2D2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC35A3Q9Y2D2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC35A3Q9Y2D2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC35A3Q9Y2D2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC35A3Q9Y2D2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC35A3Q9Y2D2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC35A3Q9Y2D2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC35A3Q9Y2D2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC35A3Q9Y2D2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC35A3Q9Y2D2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC35A3Q9Y2D2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC35A3Q9Y2D2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC35A3Q9Y2D2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC35A3Q9Y2D2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC35A3Q9Y2D2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC35A3Q9Y2D2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC35A3Q9Y2D2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC35A3Q9Y2D2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC35A3Q9Y2D2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC35A3Q9Y2D2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC35A3Q9Y2D2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC35A3Q9Y2D2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC35A3Q9Y2D2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC35A3Q9Y2D2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC35A3Q9Y2D2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC35A3Q9Y2D2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC35A3Q9Y2D2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC35A3Q9Y2D2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC35A3Q9Y2D2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC35A3Q9Y2D2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC35A3Q9Y2D2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC35A3Q9Y2D2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC35A3Q9Y2D2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC35A3Q9Y2D2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC35A3Q9Y2D2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC35A3Q9Y2D2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC35A3Q9Y2D2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC35A3Q9Y2D2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35A3Q9Y2D2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35A3Q9Y2D2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35A3Q9Y2D2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35A3Q9Y2D2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35A3Q9Y2D2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC35A3Q9Y2D2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC35A3Q9Y2D2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC35A3Q9Y2D2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC35A3Q9Y2D2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC35A3Q9Y2D2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC35A3Q9Y2D2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC35A3Q9Y2D2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC35A3Q9Y2D2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC35A3Q9Y2D2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC35A3Q9Y2D2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC35A3Q9Y2D2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC35A3Q9Y2D2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC35A3Q9Y2D2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC35A3Q9Y2D2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC35A3Q9Y2D2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC35A3Q9Y2D2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC35A3Q9Y2D2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC35A3Q9Y2D2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC35A3Q9Y2D2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC35A3Q9Y2D2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC35A3Q9Y2D2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35A3Q9Y2D2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35A3Q9Y2D2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35A3Q9Y2D2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35A3Q9Y2D2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35A3Q9Y2D2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35A3Q9Y2D2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35A3Q9Y2D2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35A3Q9Y2D2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35A3Q9Y2D2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35A3Q9Y2D2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35A3Q9Y2D2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35A3Q9Y2D2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35A3Q9Y2D2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35A3Q9Y2D2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC35A3Q9Y2D2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC35A3Q9Y2D2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC35A3Q9Y2D2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC35A3Q9Y2D2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC35A3Q9Y2D2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC35A3Q9Y2D2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC35A3Q9Y2D2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC35A3Q9Y2D2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC35A3Q9Y2D2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC35A3Q9Y2D2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC35A3Q9Y2D2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC35A3Q9Y2D2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC35A3Q9Y2D2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms