Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQR0

SCML2, Sex comb on midleg-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML2Q9UQR0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCML2Q9UQR0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCML2Q9UQR0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SCML2Q9UQR0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCML2Q9UQR0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCML2Q9UQR0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCML2Q9UQR0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCML2Q9UQR0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCML2Q9UQR0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCML2Q9UQR0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCML2Q9UQR0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCML2Q9UQR0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCML2Q9UQR0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCML2Q9UQR0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCML2Q9UQR0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCML2Q9UQR0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCML2Q9UQR0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCML2Q9UQR0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCML2Q9UQR0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCML2Q9UQR0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCML2Q9UQR0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCML2Q9UQR0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCML2Q9UQR0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCML2Q9UQR0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCML2Q9UQR0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCML2Q9UQR0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCML2Q9UQR0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCML2Q9UQR0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCML2Q9UQR0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCML2Q9UQR0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCML2Q9UQR0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCML2Q9UQR0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCML2Q9UQR0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCML2Q9UQR0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCML2Q9UQR0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCML2Q9UQR0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCML2Q9UQR0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCML2Q9UQR0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCML2Q9UQR0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCML2Q9UQR0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCML2Q9UQR0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCML2Q9UQR0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCML2Q9UQR0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCML2Q9UQR0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCML2Q9UQR0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCML2Q9UQR0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCML2Q9UQR0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCML2Q9UQR0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCML2Q9UQR0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCML2Q9UQR0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCML2Q9UQR0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCML2Q9UQR0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCML2Q9UQR0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SCML2Q9UQR0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCML2Q9UQR0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCML2Q9UQR0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCML2Q9UQR0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCML2Q9UQR0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCML2Q9UQR0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCML2Q9UQR0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCML2Q9UQR0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCML2Q9UQR0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCML2Q9UQR0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCML2Q9UQR0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCML2Q9UQR0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCML2Q9UQR0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCML2Q9UQR0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCML2Q9UQR0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SCML2Q9UQR0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCML2Q9UQR0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCML2Q9UQR0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCML2Q9UQR0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCML2Q9UQR0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCML2Q9UQR0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCML2Q9UQR0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCML2Q9UQR0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCML2Q9UQR0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SCML2Q9UQR0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SCML2Q9UQR0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCML2Q9UQR0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCML2Q9UQR0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SCML2Q9UQR0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SCML2Q9UQR0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCML2Q9UQR0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCML2Q9UQR0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCML2Q9UQR0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCML2Q9UQR0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCML2Q9UQR0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCML2Q9UQR0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCML2Q9UQR0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCML2Q9UQR0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCML2Q9UQR0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SCML2Q9UQR0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCML2Q9UQR0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCML2Q9UQR0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCML2Q9UQR0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCML2Q9UQR0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCML2Q9UQR0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCML2Q9UQR0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCML2Q9UQR0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1470.8 ms