Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVW-1Q9UQF0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVW-1Q9UQF0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVW-1Q9UQF0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVW-1Q9UQF0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVW-1Q9UQF0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVW-1Q9UQF0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVW-1Q9UQF0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVW-1Q9UQF0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVW-1Q9UQF0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVW-1Q9UQF0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVW-1Q9UQF0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVW-1Q9UQF0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVW-1Q9UQF0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVW-1Q9UQF0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVW-1Q9UQF0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVW-1Q9UQF0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVW-1Q9UQF0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVW-1Q9UQF0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVW-1Q9UQF0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVW-1Q9UQF0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVW-1Q9UQF0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVW-1Q9UQF0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ERVW-1Q9UQF0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVW-1Q9UQF0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVW-1Q9UQF0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVW-1Q9UQF0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVW-1Q9UQF0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVW-1Q9UQF0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERVW-1Q9UQF0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVW-1Q9UQF0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVW-1Q9UQF0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVW-1Q9UQF0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVW-1Q9UQF0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVW-1Q9UQF0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVW-1Q9UQF0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVW-1Q9UQF0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVW-1Q9UQF0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVW-1Q9UQF0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVW-1Q9UQF0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVW-1Q9UQF0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVW-1Q9UQF0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVW-1Q9UQF0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVW-1Q9UQF0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVW-1Q9UQF0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ERVW-1Q9UQF0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERVW-1Q9UQF0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVW-1Q9UQF0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVW-1Q9UQF0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVW-1Q9UQF0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVW-1Q9UQF0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVW-1Q9UQF0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVW-1Q9UQF0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVW-1Q9UQF0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVW-1Q9UQF0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVW-1Q9UQF0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ERVW-1Q9UQF0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVW-1Q9UQF0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVW-1Q9UQF0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERVW-1Q9UQF0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVW-1Q9UQF0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVW-1Q9UQF0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms