Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMC3Q9UQE7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMC3Q9UQE7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMC3Q9UQE7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SMC3Q9UQE7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMC3Q9UQE7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SMC3Q9UQE7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SMC3Q9UQE7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMC3Q9UQE7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMC3Q9UQE7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMC3Q9UQE7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMC3Q9UQE7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMC3Q9UQE7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMC3Q9UQE7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMC3Q9UQE7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SMC3Q9UQE7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMC3Q9UQE7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMC3Q9UQE7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMC3Q9UQE7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMC3Q9UQE7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMC3Q9UQE7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMC3Q9UQE7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMC3Q9UQE7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMC3Q9UQE7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMC3Q9UQE7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SMC3Q9UQE7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMC3Q9UQE7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMC3Q9UQE7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SMC3Q9UQE7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMC3Q9UQE7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMC3Q9UQE7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMC3Q9UQE7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SMC3Q9UQE7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SMC3Q9UQE7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMC3Q9UQE7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMC3Q9UQE7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMC3Q9UQE7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMC3Q9UQE7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMC3Q9UQE7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMC3Q9UQE7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMC3Q9UQE7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMC3Q9UQE7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMC3Q9UQE7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMC3Q9UQE7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMC3Q9UQE7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMC3Q9UQE7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMC3Q9UQE7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMC3Q9UQE7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMC3Q9UQE7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMC3Q9UQE7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMC3Q9UQE7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SMC3Q9UQE7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMC3Q9UQE7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMC3Q9UQE7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SMC3Q9UQE7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMC3Q9UQE7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMC3Q9UQE7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SMC3Q9UQE7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMC3Q9UQE7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMC3Q9UQE7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMC3Q9UQE7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMC3Q9UQE7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SMC3Q9UQE7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMC3Q9UQE7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMC3Q9UQE7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMC3Q9UQE7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMC3Q9UQE7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMC3Q9UQE7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMC3Q9UQE7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMC3Q9UQE7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMC3Q9UQE7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMC3Q9UQE7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMC3Q9UQE7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMC3Q9UQE7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMC3Q9UQE7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMC3Q9UQE7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMC3Q9UQE7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMC3Q9UQE7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMC3Q9UQE7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMC3Q9UQE7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMC3Q9UQE7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMC3Q9UQE7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMC3Q9UQE7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMC3Q9UQE7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMC3Q9UQE7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMC3Q9UQE7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMC3Q9UQE7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMC3Q9UQE7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMC3Q9UQE7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMC3Q9UQE7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SMC3Q9UQE7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SMC3Q9UQE7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMC3Q9UQE7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMC3Q9UQE7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMC3Q9UQE7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMC3Q9UQE7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMC3Q9UQE7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMC3Q9UQE7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMC3Q9UQE7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMC3Q9UQE7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms