Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PNMA3Q9UL41 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PNMA3Q9UL41 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PNMA3Q9UL41 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PNMA3Q9UL41 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PNMA3Q9UL41 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PNMA3Q9UL41 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PNMA3Q9UL41 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PNMA3Q9UL41 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PNMA3Q9UL41 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PNMA3Q9UL41 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PNMA3Q9UL41 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PNMA3Q9UL41 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PNMA3Q9UL41 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PNMA3Q9UL41 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PNMA3Q9UL41 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PNMA3Q9UL41 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PNMA3Q9UL41 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PNMA3Q9UL41 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PNMA3Q9UL41 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PNMA3Q9UL41 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PNMA3Q9UL41 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PNMA3Q9UL41 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PNMA3Q9UL41 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PNMA3Q9UL41 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PNMA3Q9UL41 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PNMA3Q9UL41 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PNMA3Q9UL41 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PNMA3Q9UL41 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PNMA3Q9UL41 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PNMA3Q9UL41 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PNMA3Q9UL41 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PNMA3Q9UL41 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PNMA3Q9UL41 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PNMA3Q9UL41 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PNMA3Q9UL41 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PNMA3Q9UL41 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PNMA3Q9UL41 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PNMA3Q9UL41 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PNMA3Q9UL41 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PNMA3Q9UL41 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PNMA3Q9UL41 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PNMA3Q9UL41 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PNMA3Q9UL41 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PNMA3Q9UL41 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PNMA3Q9UL41 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PNMA3Q9UL41 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PNMA3Q9UL41 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PNMA3Q9UL41 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PNMA3Q9UL41 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PNMA3Q9UL41 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PNMA3Q9UL41 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PNMA3Q9UL41 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PNMA3Q9UL41 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PNMA3Q9UL41 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PNMA3Q9UL41 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PNMA3Q9UL41 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PNMA3Q9UL41 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PNMA3Q9UL41 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PNMA3Q9UL41 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PNMA3Q9UL41 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PNMA3Q9UL41 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PNMA3Q9UL41 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PNMA3Q9UL41 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PNMA3Q9UL41 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PNMA3Q9UL41 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PNMA3Q9UL41 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PNMA3Q9UL41 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PNMA3Q9UL41 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PNMA3Q9UL41 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PNMA3Q9UL41 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PNMA3Q9UL41 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PNMA3Q9UL41 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PNMA3Q9UL41 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PNMA3Q9UL41 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PNMA3Q9UL41 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PNMA3Q9UL41 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PNMA3Q9UL41 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PNMA3Q9UL41 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PNMA3Q9UL41 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PNMA3Q9UL41 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PNMA3Q9UL41 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PNMA3Q9UL41 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PNMA3Q9UL41 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PNMA3Q9UL41 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PNMA3Q9UL41 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PNMA3Q9UL41 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PNMA3Q9UL41 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PNMA3Q9UL41 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PNMA3Q9UL41 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PNMA3Q9UL41 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PNMA3Q9UL41 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PNMA3Q9UL41 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PNMA3Q9UL41 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PNMA3Q9UL41 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PNMA3Q9UL41 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PNMA3Q9UL41 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PNMA3Q9UL41 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PNMA3Q9UL41 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PNMA3Q9UL41 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms