Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTRF1LQ9UGC7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTRF1LQ9UGC7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTRF1LQ9UGC7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTRF1LQ9UGC7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTRF1LQ9UGC7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTRF1LQ9UGC7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTRF1LQ9UGC7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTRF1LQ9UGC7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTRF1LQ9UGC7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MTRF1LQ9UGC7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
MTRF1LQ9UGC7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTRF1LQ9UGC7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MTRF1LQ9UGC7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTRF1LQ9UGC7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTRF1LQ9UGC7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTRF1LQ9UGC7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTRF1LQ9UGC7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTRF1LQ9UGC7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MTRF1LQ9UGC7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MTRF1LQ9UGC7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTRF1LQ9UGC7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTRF1LQ9UGC7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTRF1LQ9UGC7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTRF1LQ9UGC7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTRF1LQ9UGC7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTRF1LQ9UGC7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTRF1LQ9UGC7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTRF1LQ9UGC7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTRF1LQ9UGC7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTRF1LQ9UGC7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTRF1LQ9UGC7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTRF1LQ9UGC7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTRF1LQ9UGC7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTRF1LQ9UGC7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MTRF1LQ9UGC7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTRF1LQ9UGC7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTRF1LQ9UGC7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTRF1LQ9UGC7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MTRF1LQ9UGC7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTRF1LQ9UGC7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTRF1LQ9UGC7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTRF1LQ9UGC7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTRF1LQ9UGC7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTRF1LQ9UGC7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTRF1LQ9UGC7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTRF1LQ9UGC7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTRF1LQ9UGC7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTRF1LQ9UGC7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTRF1LQ9UGC7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTRF1LQ9UGC7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTRF1LQ9UGC7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTRF1LQ9UGC7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTRF1LQ9UGC7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTRF1LQ9UGC7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTRF1LQ9UGC7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTRF1LQ9UGC7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTRF1LQ9UGC7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTRF1LQ9UGC7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MTRF1LQ9UGC7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTRF1LQ9UGC7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTRF1LQ9UGC7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTRF1LQ9UGC7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTRF1LQ9UGC7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTRF1LQ9UGC7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTRF1LQ9UGC7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTRF1LQ9UGC7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTRF1LQ9UGC7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTRF1LQ9UGC7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTRF1LQ9UGC7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTRF1LQ9UGC7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTRF1LQ9UGC7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTRF1LQ9UGC7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTRF1LQ9UGC7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTRF1LQ9UGC7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MTRF1LQ9UGC7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTRF1LQ9UGC7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTRF1LQ9UGC7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTRF1LQ9UGC7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MTRF1LQ9UGC7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTRF1LQ9UGC7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTRF1LQ9UGC7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTRF1LQ9UGC7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTRF1LQ9UGC7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTRF1LQ9UGC7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTRF1LQ9UGC7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTRF1LQ9UGC7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTRF1LQ9UGC7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTRF1LQ9UGC7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTRF1LQ9UGC7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTRF1LQ9UGC7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTRF1LQ9UGC7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTRF1LQ9UGC7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTRF1LQ9UGC7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTRF1LQ9UGC7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTRF1LQ9UGC7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTRF1LQ9UGC7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTRF1LQ9UGC7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTRF1LQ9UGC7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTRF1LQ9UGC7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms