Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
IFT172Q9UG01 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
IFT172Q9UG01 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
IFT172Q9UG01 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
IFT172Q9UG01 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
IFT172Q9UG01 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
IFT172Q9UG01 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
IFT172Q9UG01 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
IFT172Q9UG01 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
IFT172Q9UG01 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
IFT172Q9UG01 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
IFT172Q9UG01 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
IFT172Q9UG01 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
IFT172Q9UG01 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
IFT172Q9UG01 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
IFT172Q9UG01 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
IFT172Q9UG01 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
IFT172Q9UG01 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
IFT172Q9UG01 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
IFT172Q9UG01 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
IFT172Q9UG01 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
IFT172Q9UG01 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
IFT172Q9UG01 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
IFT172Q9UG01 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
IFT172Q9UG01 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
IFT172Q9UG01 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
IFT172Q9UG01 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
IFT172Q9UG01 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
IFT172Q9UG01 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
IFT172Q9UG01 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
IFT172Q9UG01 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
IFT172Q9UG01 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
IFT172Q9UG01 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
IFT172Q9UG01 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
IFT172Q9UG01 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
IFT172Q9UG01 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
IFT172Q9UG01 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
IFT172Q9UG01 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
IFT172Q9UG01 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
IFT172Q9UG01 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
IFT172Q9UG01 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
IFT172Q9UG01 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
IFT172Q9UG01 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
IFT172Q9UG01 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
IFT172Q9UG01 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
IFT172Q9UG01 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
IFT172Q9UG01 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
IFT172Q9UG01 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
IFT172Q9UG01 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
IFT172Q9UG01 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
IFT172Q9UG01 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
IFT172Q9UG01 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
IFT172Q9UG01 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
IFT172Q9UG01 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
IFT172Q9UG01 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
IFT172Q9UG01 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
IFT172Q9UG01 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
IFT172Q9UG01 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
IFT172Q9UG01 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
IFT172Q9UG01 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
IFT172Q9UG01 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
IFT172Q9UG01 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
IFT172Q9UG01 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
IFT172Q9UG01 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
IFT172Q9UG01 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
IFT172Q9UG01 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
IFT172Q9UG01 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
IFT172Q9UG01 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
IFT172Q9UG01 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
IFT172Q9UG01 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
IFT172Q9UG01 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
IFT172Q9UG01 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
IFT172Q9UG01 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
IFT172Q9UG01 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
IFT172Q9UG01 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
IFT172Q9UG01 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
IFT172Q9UG01 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
IFT172Q9UG01 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
IFT172Q9UG01 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
IFT172Q9UG01 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
IFT172Q9UG01 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
IFT172Q9UG01 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
IFT172Q9UG01 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
IFT172Q9UG01 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
IFT172Q9UG01 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
IFT172Q9UG01 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
IFT172Q9UG01 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
IFT172Q9UG01 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
IFT172Q9UG01 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
IFT172Q9UG01 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
IFT172Q9UG01 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
IFT172Q9UG01 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
IFT172Q9UG01 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
IFT172Q9UG01 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
IFT172Q9UG01 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
IFT172Q9UG01 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
IFT172Q9UG01 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
IFT172Q9UG01 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
IFT172Q9UG01 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
IFT172Q9UG01 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms